آتشکده پاسارگاد از دیگر بناهای تاریخی پاسارگاد است که در فاصله ۱۵۰۰ متری کاخ کوروش قرار دارد. این بنا شامل دو تخته سنگ بزرگ سپید است که در نزدیکی تپهای کوچک به فاصله ۹ کیلومتری آن قرار گرفته است. این دو سنگ محل عبادتگاه پاسارگاد است که در دوران هخامنشیان یک مکان مقدس بوده است.