کلیسای ماریوخنه با قدمتی که به دوره ساسانیان بازمی‌گردد، با استفاده از آجرهای چهارگوش، به شکل مستطیل و در جهت شرقی و غربی ساخته شده است. برج ناقوس کلیسا چهار طبقه دارد که در طبقه چهارم ناقوس قرار گرفته است و روی بالاترین طبقه صلیبی فلزی به چشم می‌خورد. در وسط صحن کلیسا چهار ستون چوبی به قطر ۲۵ سانتی‌متر و پایه ستون سنگی حجاری و تزیین شده‌ای به ابعاد ۷۰ سانتی‌متر واقع شده‌اند. این اثر در تاریخ ۲۲ آبان ۱۳۶۲، با شماره ثبت ۱۶۴۸ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسید.