موزه تاریخ طبیعی اصفهان، از تاریخ طبیعت و جهان آفرینش می‌گوید. با افتتاح در سال ۱۳۶۷، هدف اصلی کار موزه بالا بردن سطح دانش و اطلاعات عمومی جامعه درباره حیات وحش و عظمت جهان آفرینش، حفظ میراث ارزنده طبیعی کشور از غارت و تخریب، جبران کمبود وسایل آموزشی، حفظ سلامت جامعه با ایجاد محیطی سالم برای تفریح، فراهم آوردن زمینه‌های تحقیقات در علوم طبیعی و کمک به افزایش جذب توریست در کشور و شهر اصفهان است. تمامی آثار طبیعی موزه در زمینه‌های علوم گیاهی-جانوری، زمین شناسی و جغرافیایی، به همت و سرمایه شخصی دکتر جعفریان، استاد دانشگاه اصفهان در طول ۳۷ سال، از نقاط مختلف ایران و جهان گردآوری، خریداری، مبادله یا تهیه شده است. بخش‌های موزه عبارتند از: سالن جانوران بی‌مهره، سالن گیاه شناسی، سالن زمین شناسی، سالن جغرافیای طبیعی و نقشه‌ها، سالن جانوران مهره‌دار و سالن کمک آموزشی و دیدنی‌های جهان خلقت.