مسجد جامع افین با بنایی ماندگار و طراحی و معماری دیدنی، از دوران سلجوقی به یادگار مانده است. امروزه این مسجد شامل بنایی نیمه‌مخروب می‌شود که تنها دیواره‌ها و گلدسته‌های اطراف ایوان آن باقی مانده‌اند. عده‌ای بر این باور هستند که اصل بنا مربوط به سده سوم تا چهارم هجری قمری است. این مسجد را به سبک آذری ساخته‌اند و آجرکاری و گچکاری‌هایی تماشایی دارد. مانند مسجد جامع قاین، این مسجد نیز دارای یک ایوان اصلی و بزرگ در وسط و دو شبستان در اطراف ایوان‌ها است. طول گلدسته‌ها به ۱۵ متر می‌رسید که در حال حاضر ۱۲ متر آن باقی مانده است. در میان گلدسته‌ها راهرویی پله‌ای شکلی وجود دارد که با استفاده از آن می‌توان به طبقات بالایی مسجد رفت. نمازخانه و محل عبادت زنان و مردان جدا از هم بودند و تعداد ۱۵ رواق در اطراف صحن قرار داشتند. منبر این مسجد از سنگ و گل ساخته شده است و بر روی آن گچکاری و همچنین آیات قرآنی دیده می‌شود. این اثر ارزشمند در تاریخ ۱۷ آذر ۱۳۷۷ با شماره‌ی ثبت ۲۱۸۲ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسید.