این مسجد درجانب غربی صحن بقعه سیدحمزه و کنار خیابان ثقة الاسلام واقع است . بنای مستطیل شکل به ابعاد ۸×۲۰ متراست که توسط یک گنبد بزرگ به قطر هشت متر ودو طاق و دو گنبد کوچکتر درشمال و جنوب مسقف می شود . دراطراف این گنبدخانه، چند رواق و اتاق قرار گرفته است و دو درگاه، آن را به خیابان ثقة الاسلام و صحن رو باز بقعه سیدحمزه مرتبط می کند . دور تا دور مسجد، از اره مرمری خوشرنگی به ارتفاع ۱۰۵ سانتی متر تعبیه گردیده که برقسمت فوقانی آن، سوره مبارکه اسراء به خط ثلث بسیار زیبا به طور برجسته نقر گردیده است . درچند جا، از اره اصلی ازبین رفته و ازاره مرمری ساده ای جایگزین آن گردیده است . درجانب شمالی در ورودی بزرگ مسجد، به جای ازاره اصلی، سنگ قبر ملامحمد باقرتبریزی- متاما بقعه سیدحمزه، متوفای ۱۱۸۸ ه-. ق- را نصب کرده و جسد نامبرده را در زیر آن به خاک سپرده اند.